EOT法拉第隔离器可与二向色玻璃偏振器或偏振分束器立方体一起使用。若要保护种子源免受Q开关激光器的背反射，EOT建议使用偏振分束器立方体，因为它们能够承受高脉冲能量。如果需要60dB隔离度以确保背向反射不会导致单频单种子激光器的频率不稳定，则可以串联使用两个隔离器。
EOT法拉第隔离器的使用注意事项：
1.铁磁物体不可放在光隔离器附近。
2.切勿尝试拆卸法拉第转子/隔离器的磁性外壳。可能会导致严重损坏。
3.来自输入和输出偏振器的被阻挡光束的反射。
4.当存在激光辐射时，操作人员不可直接通过设备观察光路。
5.外部磁场造成的危害。如带有任何磁敏感植入物（例如起搏器）会造成影响。
6.光隔离器的外部磁场可以将铁磁物体吸入，损坏设备内的光学元件,外部磁场对磁敏设备造成影响。
当EOT法拉第隔离器工作于很高的功率时，需要考虑下列效应：
1.在平均功率很高时，法拉第旋转器的寄生吸收效应会引起显著的热透镜效应，会使光束形状发生畸变，因此影响隔离度。
2.高功率装置都需要有不能通过光的出射端口，而不是采用内部减震器，是为了避免装置内部的热效应。
3.高峰值功率可能会引起光损伤。为了避免损伤，需要足够大的入射孔径。
4.高峰值功率还会引起自聚焦效应。功率极限由入射光束半径以及装置长度共同决定。
